#Persistent
Process1 := "firefox.exe"
; в Copy только файлы!
Copy1 = 
(
C:\Mozilla\Firefox\Profiles\default\places.sqlite
C:\Mozilla\Firefox\Profiles\default\prefs.js
)
Backup1 := "D:\Backup\Firefox"
Time1 := 300  ; секунды

Data := {}
while proc := Process%A_Index%  {
	i := A_Index
	obj := Data[proc] := {}
	for k, v in ["Copy", "Backup", "Time"]  {
		var := v . i
		if (%var% = "" && v != "Time")  {
			MsgBox, % "Переменная " var " не определена, присвойте значение!"
			ExitApp
		}
		obj[v] := %var%
	}
}
MyBackup := new Backup(Data)
Return

class Backup
{
	__New(data)  {
		this.data := data
		watch := this.WatchProcesses.Bind(this)
		SetTimer, % watch, 1000
	}
	WatchProcesses()  {
		for proc in this.data  {
			Process, Exist, % proc
			this.DefineAction(proc, ErrorLevel)
		}
	}
	DefineAction(proc, exist)  {
		obj := this.data[proc]
		obj.exist := exist
		if (obj.exist && !obj.exist_prev && obj.time)  {
			timer := obj.timer := this.Backups.Bind(this, obj)
			SetTimer, % timer, % (obj.time)*1000
			this.Backups(obj)
		}
		if (!obj.exist && obj.exist_prev)  {
			if (timer := obj.timer)  {
				SetTimer, % timer, Delete
				obj.timer := ""
			}
			this.Backups(obj)
		}
		obj.exist_prev := obj.exist
	}
	Backups(obj)  {
		Critical
		CoordMode, ToolTip
		dir := obj.Backup
		if !FileExist(dir)  {
			FileCreateDir, % dir
			if ErrorLevel  {
				MsgBox, % "Не удалось создать папку " dir "!`nОшибка " A_LastError
				ExitApp
			}
		}
		files := obj.Copy
		Loop, parse, files, `n, `r
		{
			if !FileExist(A_LoopField)  {
				NonExistFiles .= "`n" A_LoopField
				continue
			}
			SplitPath, A_LoopField, FileName
			if FileExist(file := dir "\" FileName)  {
				FileGetTime, CopyLastModified, % file
				FileGetTime, SourceLastModified, % A_LoopField
			}
			if !FileExist(file) || (SourceLastModified > CopyLastModified)  {
				FileCopy, % A_LoopField, % file, 1
				if ErrorLevel
					NotCopied .= "`n" A_LoopField
			}
		}
		if !NonExistFiles
			ToolTip,,,, 1
		else  {
			ToolTip, % "При попытке копирования не обнаружены файлы:`n" NonExistFiles, 1, 1, 1
			Sleep, 1000
		}
		if !NotCopied
			ToolTip,,,, 2
		else  {
			ToolTip, % "Не удалось скопировать файлы:`n" NotCopied, 500, 1, 2
			Sleep, 1000
		}
		Critical, Off
	}
}

Program1:="firefox.exe"
Copy1:="C:\Mozilla\Firefox\Profiles\default\places.sqlite", "C:\Mozilla\Firefox\Profiles\default\prefs.js"
Backup1:="D:\Backup\Firefox"
Time1: 300 ; Секунды

В остальном уточните задачу.

firefox()

firefox()
{
	FilesForCopy =
	(LTrim
	C:\Users\AERIE\AppData\Roaming\Mozilla\Firefox\Profiles\default\places.sqlite
	C:\Users\AERIE\AppData\Roaming\Mozilla\Firefox\Profiles\default\prefs.js
	)
	Loop, parse, FilesForCopy, `n, `r
	{
		;здесь действия с каждым отдельным файлом
		MsgBox, % A_LoopField  ; путь к каждому отдельному файлу в переменной A_LoopField
	}
}

firefox()
{
CopySourcePattern := "C:\Users\AERIE\AppData\Roaming\Mozilla\Firefox\Profiles\default\places.sqlite"
CopySourcePattern := "C:\Users\AERIE\AppData\Roaming\Mozilla\Firefox\Profiles\default\prefs.js"
CopyDest := "D:\Backup\Firefox"
Loop, %CopySourcePattern%
{
    copy_it = n
    IfNotExist, %CopyDest%\%A_LoopFileName% ; Всегда копировать, если одноимённый файл не существует.
        copy_it = y
    else
    {
        FileGetTime, time, %CopyDest%\%A_LoopFileName%
        EnvSub, time, %A_LoopFileTimeModified%, seconds ; Вычесть время файла-источника из времени файла-приёмника.
        if time < 0 ; Файл-источник новее, чем файл-приёмник.
            copy_it = y
    }
    if copy_it = y
    {
        FileCopy, %A_LoopFileFullPath%, %CopyDest%\%A_LoopFileName%, 1 ; Перезапись при копировании разрешена.
        if ErrorLevel
            MsgBox, Не удалось скопировать "%A_LoopFileFullPath%" в "%CopyDest%\%A_LoopFileName%".
    }
}
Return 
}

Программы, на которые срабатывает скрипт:
prog:="mpc-be64.exe"
prog:="mpc-be.exe"
prog:="firefox.exe"

Адреса копируемых файлов:
C:\KKK\Box\drive\Profile\*****\file1.exe
C:\KKK\Box\drive\Profile\*****\file2.sqlite
C:\KKK\Bkfdsa\yhkuyg\yuinv\8ojgfc\file1.txt
C:\KKK\UHfcc\hl8gf\6jkbik\ohgrg\file2.doc

Директория для копий:
D:\KKK\Box\drive\Profile\<Date_Time>

code...
code...
code...