reg add HKCU\Software\Classes\.xyz /ve /d xyzfile
reg add HKCU\Software\Classes\xyzfile\shell\open\command /ve /d "\"%~dp0Launcher.exe\" \"%%1\""

Если в этой ветке уже есть записи для такого расширения и типа файла, в обеих командах ещё нужен ключ /f для их перезаписи. Кстати, тут вам нужно подумать, что делать с существующими записями. Видимо, их нужно где-то сохранять и потом возвращать на место. Можно, в принципе, сохранять там же в реестре.

Есть ещё HKEY_CLASSES_ROOT, но она не самостоятельна, в ней отображаются те две ветки с учётом приоритета HKEY_CURRENT_USER.

очевидно, что в системе где-то прописано, что-то типа fileType "AcroExch.Document" следует открывать программой, расположенной по какому-то пути

все верно:

ftype AcroExch.Document

Если я правильно понял, то имелись в виду ассоциировние расширений с обрабатываемыми их приложениями, при этом в роли последних выступают ланчуры. Если речь о батнике, то получить путь к каталогу, в котором лежит скрипт можно через %~dp0, а прописать ассоциации - использовать команду assoc. Более подробно по данным параметрам можно узнать из комстроки, выполнив команду hh ntcmds.chm (если ХР).

попробовал в командной строке проверить ассоциацию, для, скажем pdf:

assoc .pdf

командная строка выдала

.pdf=AcroExch.Document

И так у всех расширений: для них написаны какие-то названия (fileType) уже зарегистрированных в систем хэндлеров, т.е. очевидно, что в системе где-то прописано, что-то типа fileType "AcroExch.Document" следует открывать программой, расположенной по какому-то пути (допустим c:/program files/acrobat reader/acrobat.exe), но где это прописывается? Куда и как добавлять такие связки?

Дано:
Лаунчеры находятся в той же папке, что и сам скрипт. Лаунчеры имеют статические, известные имена.

Задача скрипта:
1. получить путь к папке в которой находятся лаунчеры (и он сам)
2. прописать соответствия.

Помогите, пожалуйста.