Вот, когда-то давно я себе так написал. Стоит отметить, что скрипт удаляет вообще всё, включая папку 1CEStart, что может быть не желательно. Тут уж надо смотреть.
rem @echo off
ver | find "Windows XP"
if %errorlevel%==0 goto :eof
cd /d "%USERPROFILE%\AppData\Local\1C\"
if errorlevel 1 goto :eof
del /s /f /q *.*
cd /d "%USERPROFILE%\AppData\Roaming\1C\"
if errorlevel 1 goto :eof
del /s /f /q *.*
cd %temp%
if errorlevel 1 goto :eof
del /s /f /q *.*
cd \
goto :eof
Для XP:
rd /s /q "%USERPROFILE%\Local Settings\Application Data\1C\1Cv8\"
rd /s /q "%USERPROFILE%\Application Data\1C\1Cv8\"