Malcev, а у Вас в браузере флеш-проигрыватель стало быть отсутствует?

Присутствует.
deepNoise, алгоритм примерно такой: следите за курсором мыши и если он находится не над окном флешплеера передаете его координаты (их нужно будет пересчитывать) флешплееру.
Если вам не хочется в этом копаться, то можно заказать скрипт на платной основе. Например, у teadrinker.

А флеш-файлы чем опасны?

Тем что адобе флеш дырявый и поэтому его постоянно используют вирусописатели.
deepNoise, у меня код из 18 поста работает с вашей флешкой в любом положении окна.

stage.addChild(cursor);
cursor.mouseEnabled = false;
cursor.addEventListener(Event.ENTER_FRAME, fl_CustomMouseCursor);

function fl_CustomMouseCursor(event:Event)
{
	cursor.x = stage.mouseX;
	cursor.y = stage.mouseY;
}
Mouse.hide();

И получится этот файл, если мне не верите)

Могу исходник выложить, если экзе вас пугает.

Вот исходник: https://yadi.sk/d/kSpWKj5t3XwRXV

Во флеше стрелка привязана к курсору. В неактивном окне в открытой области стрелка двигается нормально, но при попытке зайти на перекрытую активным окном область, стрелка как бы упирается в это окно и не заходит за его границы. Как сделать, чтобы мышь могла двигаться в перекрытой области?