ReplaceText

Что это за команда? Я искал, но нашёл только другие команды.

Где это можно найти? Я не видел подобных команд в документации по AHK. Не видел, чтобы в документации было написано, что такие команды можно использовать.

File = Текст.txt
FileRead, Text, % File

Так лучше не писать, никто ведь кроме вас не знает, что там в файле, может не то что-то сохранили.
Я вижу, что ваш шаблон даже одного не находит:

Text =
(
# For documentation, see https://www.sumatrapdfreader.org/settings/settings3.2.html

MainWindowBackground = #141414
EscToExit = false
ReuseInstance = false
UseSysColors = false
RestoreSession = true
TabWidth = 300

FixedPageUI [
TextColor = #929292
BackgroundColor = #141414
SelectionColor = #f5fc0c
WindowMargin = 2 4 2 4
PageSpacing = 4 4
]
EbookUI [
FontName = Georgia
FontSize = 12.5
TextColor = #929292
BackgroundColor = #141414
UseFixedPageUI = false
]
)
RegExMatch(Text, " = #(.+)\R", Found)
MsgBox, % Found1

Пробовал таким способом:

File = Текст.txt
FileRead, Text, % File
If ErrorLevel
{
 MsgBox, Файл %File% не найден!
 Return
}

RegExMatch(Text, " = #(.+)\R", Found)

MsgBox % Found1
MsgBox % Found2
MsgBox % Found3

Идея была найти, и если есть заменить через 'StringReplace' найденное на необходимое. Но скрипт находит лишь первое совпадение в тексте.
Хотя на онлайн-сайте всё находит верно.

Пытался искать через шаблон ' = #(.+)\R' - в онлайн версии находит, в АХК нет, фиг знает что не так делаю...

text =
(
# For documentation, see https://www.sumatrapdfreader.org/settings/settings3.2.html

MainWindowBackground = #141414
EscToExit = false
ReuseInstance = false
UseSysColors = false
RestoreSession = true
TabWidth = 300

FixedPageUI [
TextColor = #929292
BackgroundColor = #141414
SelectionColor = #f5fc0c
WindowMargin = 2 4 2 4
PageSpacing = 4 4
]
EbookUI [
FontName = Georgia
FontSize = 12.5
TextColor = #929292
BackgroundColor = #141414
UseFixedPageUI = false
]
)

lineIndex := 11
charIndex := 14
charsNumber := 6
replacement := "123456"

MsgBox, % newText := ReplaceText(text, lineIndex, charIndex, charsNumber, replacement)

ReplaceText(text, lineIndex, charIndex, charsNumber, replacement) {
   Return RegExReplace(text, "([^\v]*\R){" . lineIndex - 1 . "}.{" . charIndex - 1 "}\K.{" . charsNumber . "}", replacement,, 1)
}

Извините, забыл сказать про это.

Почти так и есть - заменить 6 символов, следующих после "#" на любые другие символы латинского алфавита и числа, обозначающие цвета в кодировке HEX.

Может быть вы всё-таки знаете команду по замене строки с конкретным номером в конкретном текстовом файле?

Пример текста в файле - есть.
Что дальше? Пример замены чего на что? Минимум вариантов, только конкретная цель.

Если верно понял:
Найти '#929292' заменить на '#113399'.

Или как-то иначе?

Но не суть важно. Нужные мне символы занимают одно и то же место в тексте. Можно добиться нужного результата через замену либо символов с конкретным положением в тексте, либо всей строки. А нужной команды я не нашёл (а возможно в статье на вики не было сказано о дополнительных функциях команды).

Приведите примеры, как выглядит текст и что именно нужно найти. Чем подробней тем лучше.

Конкретно в вашем случае можно просто заменить всю строку целиком

Как? Я не нашёл такую команду