@echo off
if exist %~dp0\filelist.txt del /q /f %~dp0\filelist.txt
FOR /R %~dp0 %%i IN (*.txt) DO echo %0 "%%i" "%%i">>%~dp0\filelist.txt

Если проверка на наличие файла не нужна,то убрать из кода 2-ю строку.

Задача такая:

1. Запускается файл
2. В папке, где запущен файл, начинается поиск файлов по маске (например, txt). C подпапками
3. Все найденные файлы файлы сохраняются в файл с папкой программы в определённом виде. Пусть будет вот так:

file.exe "C:\Files\File1.txt" "C:\Files2\File1.txt"
file.exe "C:\Files\File2.txt" "C:\Files2\File2.txt"

Возможно ли это?