Т.е. допустим, имеется 8 папок, а ему нужно встроить новую на место третьей и добавить в нее новые файлы.
Я перемещаю папку 008 в 009 и переименовываю содержащиеся в ней файлы, 007 в 008 ... 003 в 004,  и создаю папку 003.

Что-то много преобразований для одной "транкзации", м.б. стоит переработать алгоритм? Или вы, в данном случае, работаете с данными, поступающими от другой программы (вид и структура данных зависит не от вас)?
Вообще в данном случае стоит задуматься о жёстких ссылках (hardlink)?

Что-то вроде такого:

:: renaming with rollback
set fromdir=001
set todir=002
set log=work.log
:: generate test data
call :generate
:: create moving log
call :prepare %fromdir%
for /f "tokens=*" %%a in ('type %log%') do (
:: move
call :move %%a %fromdir% %todir%) 
:: rollback
for /f "tokens=*" %%a in ('type %log%') do (
call :rollback %%a %fromdir% %todir%) 
exit /b

:generate
if exist %fromdir% rd /s/q %fromdir%
if exist %todir% rd /s/q %todir%
md %fromdir%
md %todir%
for /l %%a in (1,1,99) do (echo.>%fromdir%\%%a.file)
for /l %%a in (101,1,199) do (echo.>%todir%\%%a.file)
exit /b

:prepare
dir /b /a /s %1 > %log%
exit /b

:move
setlocal enabledelayedexpansion
set name=%1
move /y !name! !name:%2=%3!
exit /b & endlocal

:rollback
setlocal enabledelayedexpansion
set name=%1
move /y !name:%2=%3! !name! 
exit /b & endlocal

Как вариант (robocopy в составе ОС, начиная с Vista и новее):

robocopy "from" "to" /mov

или

robocopy "from" "to" /move

Но команда незнакомая. Где можно почитать о ней?

Как обычно:

rd /?

Или в справке (зависит от ОС).

Именно.

rd /s/q "path_to_TEMP_directory"

Спасибо, работает!
Но команда незнакомая. Где можно почитать о ней?

Если системный диск С: а рабочая директория на другом диске, то при попытке выполнить MOVE "D:\path_directory" %TEMP% получаю сообщение "Отказано в доступе".  Я это понял так, что перемещение каталога доступно лишь в пределах одного диска, а %TEMP% расположена именно на системном.

1.  Каждая из 00N папок содержит еще целое дерево директорий и файлов там чертова туча. Проверять каждый - поседеешь. А MOVE, раз - и готово.
2. По техзаданию должно быть не более 3 файлов, .bat .ini .dat .  Поначалу требовали вообще одним батником ограничиться, но тут уж я рогом уперся.

Еще раз хочу искренне поблагодарить за помощь!
И Rom5 тоже!

Например, в менеджере "Total Commander" есть очень удобная утилитка пакетного переименования - Multi-Rename Tool вызываемая по Ctrl+M после отметки переименовываемых файлов/директорий.

В качестве будущих имен можно взять часть предыдущего имени плюс счетчик с указанием начального значения. Если из утилиты еще не вышли - можно выполнить откат переименования.

Вот, скриншот:

...

Не устраивает видимо тем, что рабочая папка и системная "тэмповая" могут получиться на разных томах, что приведет при "переименованиях" к физическому перемещению туда и обратно папок пользователя со всем содержимым, т.е. времязатратно...

Привет честной компании!
Нарисовалась проблема, голову сломал...

Привет и вам.

Может быть составите алгоритм или представите код? Потому как у меня вырисовывается такая картина:

1. Получить список имеющихся папок

2. Получить имя папки, если такой нет, то создать, иначе:
   

   • Попытаться прочесть файлы (или проверить handle, утилитой от М.Руссиновича), если всё ок - переместить файлы из "исходной" директории в "исходная+1"

   • иначе вывести предупреждение или "покиллять" приложения, открывшие файлы

3. -> п.1

rd /s/q "path_to_TEMP_directory"

А почему не устраивает другой диск? К примеру, мне удобно использовать (и переопределять в скриптах - для отладки) некоторые переменные оболочки, в т.ч. %TMP% и %TEMP%? К чему такая категоричность и почему это так важно, ведь "временная директория" на то и "временная"? В вашей записи я ответа не нашёл.