За сложный вариант огромное спасибо, но чтобы он отработал его надо запускать непосредственно в этой папке.  Как снять это ограничение, чтобы запуск можно было производить с любого места на диске?

Добавить после «setlocal enabledelayedexpansion» «pushd "D:\papka\other"» и «popd» — перед «endlocal».

ren *.vir *.exe

Или более сложный вариант для приведения к виду NNNN.exe, где NNNN - числа вида 0001, 0002, ...

@echo off

setlocal enabledelayedexpansion

set /a "I=0"

for %%f in ( *.vir ) do (
    set /a "I+=1"
    set "N=0000!I!"
    set "N=!N:~-4!"
    ren "%%~f" "!N!.exe"
)

endlocal