ypppu пишет:

AHK: MasterScript (менеджер .ahk скриптов)
AHK: Коллекция скриптов для комфортной работы в одном

Спасибо большое за совет, но мне это не очень подходит.

Это подойдет, свой код в каждый этап вписывай:

; v nachale scripta
etap := 1

F1::
; perekluchaem etap po F1
if (etap > 4)
msgbox, Все этапы закончены, перезапустите скрипт для повтора
else
{
GOSUB etap%etap%
etap := etap + 1
}
return 

etap1:
msgbox, etap 1
return

etap2:
msgbox, etap 2
return

etap3:
msgbox, etap 3
return

etap4:
msgbox, etap 4
return

AHK: MasterScript (менеджер .ahk скриптов)
AHK: Коллекция скриптов для комфортной работы в одном

Спасибо большое за совет, но мне это не очень подходит.

Вот пример моего куска кода

F1::
MouseClick, left,  658,  423
Sleep, 100
Send, van{SPACE}
MouseClick, left,  658,  429
Sleep, 100
MouseClick, left,  704,  621
Sleep, 100
Send, 150000
MouseClick, left,  1359,  719
Sleep, 100

F2::
MouseClick, left,  658,  423
Sleep, 100
Send, roon
MouseClick, left,  658,  429
Sleep, 100
MouseClick, left,  704,  621
Sleep, 100
Send, 30000
MouseClick, left,  1359,  719
Sleep, 100

Etap := 0
Kolichestvo_etapov := 2
x:: ; Ты просил повесить на клавишу [х]
Etap := Etap+1
If (Etap > Kolichestvo_etapov) {
    MsgBox Закончили!
    ExitApp
    }
Gosub %Etap%
return

1:
MsgBox, Этап 1.
;Твой код
Return

2:
MsgBox, Этап 2.
;Твой код
Return

На бинд функцию повесь, которая читает текущий этап из глобальной переменной, запускает нужный скрипт в зависимости от этапа и  увеличивает эту переменную на единицу.

А можешь пожалуйста подсказать как это будет выглядить в коде? А то я почти не разбираюсь в AHK

Образно говоря запустил скрипт, он выполнил первый этап, ждёт команды, нажал клавишу X, запустился второй этап, ждёт команды, нажал эту же клавишу X, третий этап и.т.д

Заранее спасибо